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Textdatei manipulieren mit sed
Ich habe eine Textdatei in der spezische Werte drin stehen.
Ein Auszug
Ich möchte nun mittels sed jede Zeile die z.B. rs2274064 enthält, aus der Datei heraus haben.
Meine Idee dazu war:
Es wird zwar ohne Fehlermeldung ausgeführt aber die Zeilen werden nicht aus der Datei entfernt.
Was mache ich falsch?
Ein Auszug
A1 228484 NCF2_rs2274064 UNKNOWN
A2 234872 NCF2_rs2274064 UNKNOWN
A3 235050 NCF2_rs2274064 UNKNOWN
A7 228484 ATP13A4_rs6788448 UNKNOWN
A8 234872 ATP13A4_rs6788448 UNKNOWN
A9 235050 ATP13A4_rs6788448 UNKNOWN Ich möchte nun mittels sed jede Zeile die z.B. rs2274064 enthält, aus der Datei heraus haben.
Meine Idee dazu war:
grep rs2274064 foo.txt >bar.txt
while IFS= read -r line; do sed -i 's/"$line"//g' foo.txt; done <bar.txt Es wird zwar ohne Fehlermeldung ausgeführt aber die Zeilen werden nicht aus der Datei entfernt.
Was mache ich falsch?
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Printed on: April 27, 2024 at 18:04 o'clock
2 Comments
Latest comment
Grep reicht in dem Fall völlig...
Mit sed geht sowas so
grep -iv 'rs2274064' foo.txt >bar.txt sed -e '/rs2274064/d' foo.txt >bar.txt 
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fantastisch!